Notre service de test d’expression protéique haut débit est la solution pour surmonter les défis les plus exigeants liés aux protéines difficiles à exprimer ! ProteoGenix a développé une plateforme HTP dédiée à l’optimisation de l’expression protéique. Notre solution : plus de 1000 conditions d’expression soigneusement sélectionnées et testées en parallèle pour propulser en un temps record votre production de protéines.

Test haut débit d’expression protéique pour protéines difficiles à exprimer

ProteoGenix réunit les connaissances de ses meilleurs experts pour vous proposer la plateforme d’expression protéique haut débit la plus avancée. Conçue selon une règle : « Plus nous testons de conditions pertinentes, plus nous avons de chances d’exprimer votre protéine avec succès ». Notre plateforme permet donc de tester 1000 conditions en 4 semaines afin de répondre, voire dépasser, vos exigences en termes de :

  • Productivité
  • Purté
  • Solubilité
  • Stabilité
  • Activité biologique

De tels résultats ne sont possibles qu’en proposant un vaste panel de conditions. Voici la liste des paramètres que ProteoGenix peut faire varier :

Possibilités en biologie moléculaire

Synthèse de gènes

ILLIMITÉ

Vecteurs

ILLIMITÉ

Peptides signaux

250+

Tag de purification

15+

Tag de solubilité

15+

Souches et lignées cellulaires

Conditions de culture

Température

Conditions d’induction

Criblage des milieux

Méthode d’extraction

Fermentation

ILLIMITÉ

Purification

Purification

Vous rencontrez des difficultés pour optimiser l’expression de vos protéines ? Contactez nos chefs de projet PhD pour optimiser votre production.

Notre workflow d’expression protéique haut débit

Détermination du meilleur couple hôte/vecteur

  • Test de plusieurs transformants
  • Sélection des meilleurs résultats
  • Tests de purification sur le couple optimal
GO/NO GO

Optimisation de l’expression protéique en flacon

  • Optimisation de plusieurs conditions de culture (température, temps d’induction…)
  • Détermination de la meilleure stratégie d’alimentation
GO/NO GO

Optimisation de la purification protéique

GO/NO GO

Optimisation de l’expression protéique en bioréacteur

  • Optimisation des paramètres opératoires de fermenteur/bioréacteur
  • Purification des protéines et analyses QC : SDS/Page, Western

Exemple de projet type

320 TESTS

  • 4 souches d’E. coli
  • 4 lignées cellulaires de mammifères
  • 2 tags de purification
  • 2 synthèses de gènes
  • 4 vecteurs
  • 5 peptides signaux

2 meilleures combinaisons systèmes/constructions

1350 TESTS

  • 3 températures
  • 9 conditions d’induction
  • 5 optimisations de purification
  • 5 méthodes d’extraction

Sélection de la meilleure condition d’expression

200 criblages de milieux

5 meilleures conditions de fermentation

1875 TESTS

Étape Contenu Délais Livrables
Détermination du couple hôte/vecteur
  • Synthèse de gène avec optimisation des codons
  • Sous-clonage dans les vecteurs d’expression
  • Purification des meilleurs résultats
  • À définir selon le projet
  • Constructions géniques
  • Rapport détaillé avec la liste des tests réalisés
  • Protéine purifiée issue du test de purification
Optimisation de l’expression protéique
  • Optimisation des conditions de culture
  • À définir selon le projet
  • Échantillon de test si requis Rapport détaillé
Optimisation de la purification protéique
  • Détermination de la meilleure stratégie de purification
  • À définir selon le projet
  • Protéine purifiée Rapport détaillé
Développement de procédé
  • Optimisation des paramètres de bioréacteur Analyse QC
  • À définir selon le projet
  • Protéine purifiée Rapport détaillé
Options
  • Élimination de tag par clivage enzymatique
  • Dosage et élimination d’endotoxines
  • Montée en échelle / Fermentation

Influence de plusieurs paramètres sur l’expression protéique

La production de protéines difficiles à exprimer requiert de faire varier de multiples paramètres pouvant influencer fortement le rendement final, la pureté, la stabilité, la solubilité et l’activité biologique. Si l’on se concentre sur la productivité, voici quelques paramètres à considérer pour l’optimisation de l’expression protéique :

Système d’expression

Le choix du système d’expression optimal est primordial pour l’expression protéique. Il dépend de vos besoins : rendement élevé, repliement correct, modifications post-traductionnelles « human-like » ou compromis selon l’objectif. Voici un tableau présentant les paramètres essentiels à prendre en compte pour choisir le bon système d’expression :

Séquence génique

La synthèse de gène doit être optimisée pour l’organisme hôte grâce à l’optimisation des codons. Ce procédé vise à éviter les codons rares dans la séquence ARNm afin de réduire le risque d’échec d’expression et d’augmenter les probabilités d’obtenir une forte production protéique.

Vecteur

L’optimisation de l’expression passe aussi par le choix du meilleur vecteur d’expression. La partie non-codante régule plusieurs éléments essentiels :

  • Le promoteur doit être adapté à la nature de la protéine à exprimer. Pour les protéines toxiques, privilégiez un promoteur à faible expression basale. Les promoteurs forts sont préférés pour obtenir des rendements élevés.
  • Le terminateur régule la dégradation de l’ARNm et augmente la stabilité cytoplasmique.
  • L’origine de réplication contrôle le nombre de copies du plasmide. Choisir un plasmide à nombre de copies élevé peut aider si le rendement est limité.

Conditions d’expression

Divers facteurs influencent l’expression des protéines :

  • Température : dans les systèmes prokaryotes comme E. coli, cela influe sur le repliement et la formation de corps d’inclusion. L’induction à basse température améliore la solubilité. L’expression hypothermique dans les cellules mammifères augmente les rendements.
  • Concentration de l’inducteur : une concentration plus faible réduit la transcription et limite les agrégats, améliorant la solubilité.
  • Milieux : il doit contenir tous les nutriments nécessaires pour favoriser l’expression recombinante.

 

Cette liste n’est pas exhaustive. Grâce à notre service haut débit, ProteoGenix optimise bien plus de paramètres. Contactez-nous pour échanger avec un chef de projet PhD sur vos besoins spécifiques et déterminer ensemble les meilleures conditions pour optimiser votre expression protéique.