SERVIZI DI SINTESI GENICA

• ProteoGenix ha sviluppato un algoritmo di ottimizzazione dei codoni unico basato su dati sperimentali.
• Molti amminoacidi sono codificati da più codoni, detti codoni sinonimi. Tuttavia, alcuni codoni sono usati più frequentemente di altri durante la traduzione. Questo fenomeno, chiamato bias d’uso dei codoni, è specie-specifico. Grazie alla ridondanza del codice genetico, i codoni rari possono essere sostituiti con quelli più abbondanti dell’organismo ospite, senza cambiare la sequenza amminoacidica della proteina. Il Tool di Ottimizzazione dei Codoni di ProteoGenix utilizza una strategia di bias sui codoni e parametri come contenuto GC, sequenze ripetute, siti di restrizione e struttura secondaria dell’mRNA.
• Le applicazioni includono:

1. Facilità di sintesi DNA: il nostro tool gratuito migliora l’efficienza nella progettazione dei geni sintetici, considerando bias naturale e complessità di sintesi.
2. Produzione di proteine ricombinanti in diversi sistemi: l’ottimizzazione dei codoni è essenziale per la produzione, facilita il subclonaggio e migliora espressione e resa.
3. Terapia genica: l’ottimizzazione dei codoni viene applicata per trattare patologie come la distrofia muscolare di Duchenne (Athanasopoulos, T et al, 2011) e l’Epatite C (Frelin L et al, 2004).
4. Immunizzazione genetica: si ottiene una risposta immunitaria iniettando direttamente il gene dell’antigene negli animali. Le DNA vaccine sono fondamentali quando una proteina è difficile da esprimere o purificare; è dimostrato che i geni wild type producono una risposta minore rispetto ai geni ottimizzati (Stratford et al., 2000; Uchijima et al., 1998). Gli adjuvanti migliorano la risposta alle proteine ricombinanti, ma per i vaccini a DNA non sono previsti. Tuttavia, l’ingegnerizzazione di CpG island nei DNA vaccine ne migliora l’immunogenicità (Krieg et al., 1998). La sintesi DNA personalizzata aggiunge valore significativo.

Subclonaggio genico in uno dei nostri vettori o direttamente in quello fornito dal cliente

Mutagenesi sito-specifica da qualsiasi template fornito

• ProteoGenix fornisce librerie di varianti geniche con modifiche in una o più posizioni per ottimizzare l’espressione proteica. Questo servizio è utile per screening ad alto rendimento come l’ingegneria proteica (modifica/mutazione di AA in diverse posizioni).

• Come azienda leader nella sintesi genica, ProteoGenix offre anche servizi di amplificazione plasmidica senza endotossina. Dopo la ottimizzazione e il clonaggio, è spesso necessario amplificare la costruzione per ottenere quantità sufficienti di plasmide privi di endotossina per gli esperimenti.

• Bicc1 Polymerization Regulates the Localization and Silencing of Bound mRNA Benjamin Rothé,a Lucia Leal-Esteban,a Florian Bernet,a Séverine Urfer,a Nicholas Doerr,b Thomas Weimbs,b Justyna Iwaszkiewicz,c and Daniel B. Constama
• Fine Mapping and Characterization of the L-Polymerase-Binding Domain of the Respiratory Syncytial Virus Phosphoprotein Julien Sourimant,a,c Marie-Anne Rameix-Welti,a,c,d Anne-Laure Gaillard,a Didier Chevret,b Marie Galloux,a Elyanne Gault,c,d and Jean-François Eléouëta

• Matthias Canault,1,2,3 Dorsaf Ghalloussi,1,2,3 Charlotte Grosdidier,1,2,3 Marie Guinier,4 Claire Perret,5,6,7 Nadjim Chelghoum,4 Marine Germain,5,6,7 Hana Raslova,8 Franck Peiretti,1,2,3 Pierre E. Morange,1,2,3 Noemie Saut,1,2,3 Xavier Pillois,9,10 Alan T. Nurden,10 François Cambien,5,6,7 Anne Pierres,3,11,12 Timo K. van den Berg,13 Taco W. Kuijpers,13 Marie-Christine Alessi,1,2,3 and David-Alexandre Tregouet5,6,7. Interaction of a Partially Disordered Antisigma Factor with Its Partner, the Signaling Domain of the TonB-Dependent Transporter HasR.
• Idir Malki,1,2,3 Catherine Simenel,1,2 Halina Wojtowicz,1,2 Gisele Cardoso de Amorim,1,2 Ada Prochnicka-Chalufour,1,2 Sylviane Hoos,4 Bertrand Raynal,4 Patrick England,4 Alain Chaffotte,1,2 Muriel Delepierre,1,2 Philippe Delepelaire,5 and Nadia Izadi-Pruneyre1,2. Kinetics of nif Gene Expression in a Nitrogen-Fixing Bacterium.
• César Poza-Carrión, Emilio Jiménez-Vicente, Mónica Navarro-Rodríguez, Carlos Echavarri-Erasun, and Luis M. Rubio. Bacterial cytoplasm as an effective cell compartment for producing functional VHH-based affinity reagents and Camelidae IgG-like recombinant antibodies
• Selma Djender, Aurelie Schneider, Anne Beugnet, Ronan Crepin, Klervi Even Desrumeaux, Chiara Romani, Sandrine Moutel, Franck Perez, and Ario de Marco

• Davita Pillay,1,* Julien Izotte,1 Regassa Fikru,2,3,4 Philipe Büscher,3 Hermogenes Mucache,5 Luis Neves,5 Alain Boulangé,5,7 Momar Talla Seck,6 Jérémy Bouyer,6,7,8Grant B. Napier,9 Cyrille Chevtzoff,10 Virginie Coustou,1 and Théo Baltz1. α-Catenin and Vinculin Cooperate to Promote High E-cadherin-based Adhesion Strength.
• William A. Thomas,a,b Cécile Boscher,c,d,1 Yeh-Shiu Chu,e,2 Damien Cuvelier,f Clara Martinez-Rico,b Rima Seddiki,c,d,g Julie Heysch,b Benoit Ladoux,g,h Jean Paul Thiery,e,h,i,j,3 René-Marc Mege,c,d,3 and Sylvie Dufourb,3,4

• Recognition of Multivalent Histone States Associated with Heterochromatin by UHRF1 Protein
• Nataliya Nady, Alexander Lemak,,1 John R. Walker,,1 George V. Avvakumov,,1 Michael S. Kareta,,1 Mayada Achour, Sheng Xue, Shili Duan, Abdellah Allali-Hassani, Xiaobing Zuo, Yun-Xing Wang, Christian Bronner, Frédéric Chédin, Cheryl H. Arrowsmith,,2 and Sirano Dhe-Paganon