Cos'è il sequenziamento proteico de novo degli anticorpi?

A differenza di un classico servizio di sequenziamento da ibridoma, il sequenziamento anticorpale de novo determina la sequenza di amminoacidi di un anticorpo senza bisogno di mRNA, DNA o una linea cellulare ibridoma. Analizzando le differenze di massa tra gli ioni frammentati, è possibile ricostruire le sequenze peptidiche — la maggior parte degli amminoacidi ha masse uniche, rendendo il processo possibile anche senza informazioni genetiche. L’interpretazione moderna degli spettri MS/MS si basa su analisi esperte o algoritmi avanzati (PEAKS, NOVOR). Sebbene rimangano alcune sfide (modifiche post-traduzionali, rumore, ioni mancanti), le tecnologie più avanzate ora rendono il processo rapido, affidabile e molto accurato. Grazie ai più recenti progressi nella spettrometria di massa, ProteoGenix garantisce quasi il 100% di accuratezza della sequenza, incluse le regioni CDR.

Quali sono i vantaggi del sequenziamento proteico rispetto al classico sequenziamento del DNA?

Non serve una linea cellulare. Se perdi l’ibridoma, puoi comunque recuperare l’anticorpo. Le modifiche post‑traduzionali vengono individuate, cosa non possibile con il sequenziamento del DNA. Funziona per qualsiasi isotipo e qualsiasi specie. Adatto a progetti di sequenziamento ad alto throughput. Questo lo rende una soluzione preziosa quando serve un’alternativa rapida e pratica rispetto al tradizionale servizio di sequenziamento da ibridoma.

Combinano diversi metodi di frammentazione?

Sì. Usiamo EThcD, che unisce i punti di forza di ETD e HCD. Questo doppio approccio consente: Una doppia conferma della sequenza Migliore conservazione delle modifiche post-traduzionali Massima accuratezza in regioni complesse come CDR-H3

Di quanto anticorpo avete bisogno?

Richiediamo di solito 50–100 μg di anticorpo con >80% di purezza.

Una volta ottenuta la sequenza, potete produrre o ottimizzare l’anticorpo?

Certamente. ProteoGenix è un fornitore leader di produzione di anticorpi personalizzati (custom antibody production) e servizi downstream di ingegneria anticorpale (antibody engineering), supportando ciascuna fase dall’espressione fino all’ottimizzazione funzionale. Tutte le sequenze ottenute tramite il nostro servizio di sequenziamento anticorpale possono essere prodotte con i nostri servizi di produzione di anticorpi ricombinanti, tramite espressione anticorpale transiente o attraverso sviluppo di linee cellulari custom per una produzione a lungo termine. Per raffinare ulteriormente la molecola, offriamo anche: servizi di maturazione dell’affinità (affinity maturation services) servizi di umanizzazione anticorpale (antibody humanization) servizi di valutazione della developabilità (developability assessment services) Sia che ti serva espressione rapida, produzione ricombinante su larga scala o ingegneria avanzata, la nostra piattaforma garantisce un flusso di lavoro completo e integrato dal sequenziamento fino all’ottimizzazione degli anticorpi.

Servizio di sequenziamento proteico de novo

Hai perso il tuo ibridoma? Il tuo anticorpo non è perso.

Salva subito il tuo anticorpo

1 settimana

Da anticorpo purificato a sequenza

99%

Tasso di successo

50 µg

Anticorpo purificato necessario

Perdere il tuo ibridoma non significa perdere anni di lavoro. Con soli 50 μg di anticorpo purificato, il nostro servizio di sequenziamento anticorpale de novo può recuperare la tua sequenza.

Un modo garantito per mettere al sicuro il tuo anticorpo

Il nostro tasso di successo si avvicina al 100%. Ecco perché applichiamo una regola chiara: otteniamo la sequenza del tuo anticorpo o non paghi nulla.

Voglio sequenziare il mio anticorpo

Compatibile con tutti i formati di anticorpi e specie

Il nostro servizio di sequenziamento anticorpale de novo funziona con ogni isotipo o formato: IgG, IgA, IgM, IgY, Fab, scFv, VHH, bispecifici, policlonali, da topo, ratto, coniglio, camelide e molti altri.

Produzione ricombinante opzionale a costi competitivi

Puoi combinare il sequenziamento con la nostra piattaforma per la produzione di anticorpi ricombinanti. Questo ti permette di mantenere la sequenza e ottenere una versione ricombinante a un prezzo competitivo, tutto gestito da un unico fornitore esperto.
E ancora: se non possiamo produrre il tuo anticorpo ricombinante, non paghi nessuna delle due fasi.

Voglio sequenziare e produrre il mio anticorpo

Il nostro servizio di sequenziamento proteico anticorpale in dettaglio: da anticorpo purificato a sequenza in 1 settimana

Digestione enzimatica dell’anticorpo

Frammenta l’anticorpo in peptidi definiti
Genera dimensioni ottimali di peptidi per acquisizione MS/MS
Garantisce copertura completa delle regioni variabili e costanti

LC-MS/MS

Separa i peptidi prima della ionizzazione
Produce spettri ad alta risoluzione per ogni frammento
Acquisisce serie ioniche b/y e c/z per un’analisi accurata

Sequenziamento peptidico de novo

Ricostruisce le sequenze peptidiche direttamente dagli spettri MS/MS
Convalida la copertura tramite sovrapposizione coerente
Segnala eventuali regioni ambigue per la revisione di esperti

Assemblaggio dei peptidi sovrapposti

Ricostruisce le sequenze peptidiche direttamente dagli spettri MS/MS
Convalida la copertura tramite sovrapposizione coerente
Segnala eventuali regioni ambigue per la revisione di esperti

Analisi dei dati e stesura del report

Fornisce un report completo e annotato con sequenza e PTM
Determina leucina/isoleucina tramite firme di frammentazione dedicate

FAQ sul nostro servizio di sequenziamento proteico de novo degli anticorpi

A differenza di un classico servizio di sequenziamento da ibridoma, il sequenziamento anticorpale de novo determina la sequenza di amminoacidi di un anticorpo senza bisogno di mRNA, DNA o una linea cellulare ibridoma.
Analizzando le differenze di massa tra gli ioni frammentati, è possibile ricostruire le sequenze peptidiche — la maggior parte degli amminoacidi ha masse uniche, rendendo il processo possibile anche senza informazioni genetiche.
L’interpretazione moderna degli spettri MS/MS si basa su analisi esperte o algoritmi avanzati (PEAKS, NOVOR). Sebbene rimangano alcune sfide (modifiche post-traduzionali, rumore, ioni mancanti), le tecnologie più avanzate ora rendono il processo rapido, affidabile e molto accurato.
Grazie ai più recenti progressi nella spettrometria di massa, ProteoGenix garantisce quasi il 100% di accuratezza della sequenza, incluse le regioni CDR.
- Non serve una linea cellulare. Se perdi l’ibridoma, puoi comunque recuperare l’anticorpo.
- Le modifiche post‑traduzionali vengono individuate, cosa non possibile con il sequenziamento del DNA.
- Funziona per qualsiasi isotipo e qualsiasi specie.
- Adatto a progetti di sequenziamento ad alto throughput.
Questo lo rende una soluzione preziosa quando serve un’alternativa rapida e pratica rispetto al tradizionale servizio di sequenziamento da ibridoma.
Sì. Usiamo EThcD, che unisce i punti di forza di ETD e HCD.
Questo doppio approccio consente:
- Una doppia conferma della sequenza
- Migliore conservazione delle modifiche post-traduzionali
- Massima accuratezza in regioni complesse come CDR-H3
Certamente. ProteoGenix è un fornitore leader di produzione di anticorpi personalizzati (custom antibody production) e servizi downstream di ingegneria anticorpale (antibody engineering), supportando ciascuna fase dall’espressione fino all’ottimizzazione funzionale.
Tutte le sequenze ottenute tramite il nostro servizio di sequenziamento anticorpale possono essere prodotte con i nostri servizi di produzione di anticorpi ricombinanti, tramite espressione anticorpale transiente o attraverso sviluppo di linee cellulari custom per una produzione a lungo termine.
Per raffinare ulteriormente la molecola, offriamo anche:
Sia che ti serva espressione rapida, produzione ricombinante su larga scala o ingegneria avanzata, la nostra piattaforma garantisce un flusso di lavoro completo e integrato dal sequenziamento fino all’ottimizzazione degli anticorpi.