Was ist de-novo Antikörper-Protein-Sequenzierung?

Im Gegensatz zur klassischen Hybridom-Sequenzierung bestimmt die De-novo-Antikörper-Sequenzierung die Aminosäuresequenz eines Antikörpers ohne mRNA, DNA oder Hybridom-Zelllinie. Durch die Analyse von Massendifferenzen der Fragmentionen lassen sich Peptidsequenzen rekonstruieren – die meisten Aminosäuren haben einzigartige Massen, sodass die Methode auch ohne genetische Informationen funktioniert. Moderne MS/MS-Interpretation basiert auf Expertenanalyse oder fortschrittlichen Algorithmen (PEAKS, NOVOR). Herausforderungen sind etwa posttranslationale Modifikationen, Störsignale und fehlende Ionen – aktuelle Technologien machen den Prozess jedoch schnell, zuverlässig und hochgenau. Dank neuester Massenspektrometrie garantiert ProteoGenix eine nahezu 100%ige Sequenzgenauigkeit, auch in CDR-Regionen.

Was sind die Vorteile der proteinbasierten Sequenzierung gegenüber der klassischen DNA-Sequenzierung?

Sie benötigen keine Zelllinie. Ist das Hybridom verloren, kann der Antikörper dennoch gerettet werden. Posttranslationale Modifikationen werden erkannt – das ist mit DNA-Sequenzierung nicht möglich. Funktioniert für jeden Isotyp und jede Spezies. Eignet sich auch für Hochdurchsatz-Sequenzierungsprojekte. Das macht diese Methode zu einer wertvollen Option, wenn Sie eine schnelle, praktische Alternative zur klassischen Hybridoma-Sequenzierung benötigen.

Kombinieren Sie mehrere Fragmentierungsmethoden?

Ja. Wir setzen EThcD ein und kombinieren damit die Vorteile von ETD und HCD. Dieser doppelte Ansatz ermöglicht: Doppelte Sequenzbestätigung Bessere Erhaltung posttranslationaler Modifikationen Überlegene Genauigkeit in komplexen Regionen wie CDR-H3

Wie viel Antikörper benötigen Sie?

In der Regel benötigen wir 50–100 μg Antikörper bei >80 % Reinheit.

Können Sie nach der Sequenzierung auch den Antikörper produzieren oder optimieren?

Selbstverständlich. ProteoGenix ist ein führender Anbieter für maßgeschneiderte Antikörperproduktion und nachgelagerte Antikörper-Engineering-Services. Wir begleiten Sie von der Expression bis zur funktionellen Optimierung. Alle über unseren Antikörper-Protein-Sequenzierungsservice erhaltenen Sequenzen können über unsere rekombinante Antikörperproduktion exprimiert werden – entweder mittels transienter Expression oder durch maßgeschneiderte Zelllinienentwicklung für die langfristige Herstellung. Zur weiteren Optimierung bieten wir außerdem: Affinity Maturation Antikörper-Humanisierung Developability Assessment Ob schnelle Expression, großtechnische Produktion oder fortgeschrittenes Engineering – unsere Plattform bietet einen durchgängigen Workflow von der Sequenzierung bis zum optimierten Antikörper.

De-novo-Protein-Sequenzierungsservice

Hybridom verloren? Ihr Antikörper ist nicht verloren.

Antikörper jetzt sichern

1 Woche

Von gereinigtem Antikörper zur Sequenz

99%

Erfolgsrate

50 µg

Benötigte Menge gereinigter Antikörper

Der Verlust Ihres Hybridoms bedeutet nicht den Verlust von Jahren an Arbeit. Mit nur 50 μg gereinigtem Antikörper kann unser De-novo-Antikörper-Sequenzierungsservice Ihre Sequenz wiederherstellen.

Ein garantierter Weg, Ihren Antikörper zu sichern

Unsere Erfolgsquote liegt bei nahezu 100 %. Deshalb gilt bei uns die klare Regel: Wir bestimmen Ihre Antikörpersequenz, oder Sie zahlen nichts.

Ich möchte meinen Antikörper sequenzieren

Kompatibel mit allen Antikörperformaten und Spezies

Unser De-novo-Antikörper-Sequenzierungsservice funktioniert mit jedem Isotyp und Format: IgG, IgA, IgM, IgY, Fab, scFv, VHH, bispezifische, polyklonale Antikörper, von Maus, Ratte, Kaninchen, Kamelide und vielen weiteren Arten.

Optionale rekombinante Produktion zu attraktiven Konditionen

Sie können die Sequenzierung mit unserer rekombinanten Antikörperproduktionsplattform kombinieren. So sichern Sie die Sequenz und erhalten eine rekombinante Version zum attraktiven Preis – alles aus einer erfahrenen Hand.
Auch hier gilt: Wenn wir Ihren rekombinanten Antikörper nicht produzieren können, zahlen Sie für keinen der Schritte.

Ich möchte meinen Antikörper sequenzieren und produzieren

Unser Antikörper-Protein-Sequenzierungsservice im Detail: von gereinigtem Antikörper zur Sequenz in 1 Woche

Enzymatische Verdauung des Antikörpers

Zerkleinert den Antikörper in definierte Peptidfragmente
Erzeugt optimale Peptidlängen für MS/MS-Analyse
Gewährleistet vollständige Abdeckung variabler und konstanter Bereiche

LC-MS/MS

Trennt Peptide vor der Ionisierung
Erzeugt hochauflösende Spektren für jedes Fragment
Erfasst sowohl b/y- als auch c/z-Ionenserien für präzise Analysen

De-novo-Peptidsequenzierung

Rekonstruiert Peptidsequenzen direkt aus MS/MS-Spektren
Validiert Abdeckung durch Überlappungskonsistenz
Hebt etwaige unklare Regionen zur Expertenprüfung hervor

Zusammenfügen überlappender Peptide

Rekonstruiert Peptidsequenzen direkt aus MS/MS-Spektren
Validiert Abdeckung durch Überlappungskonsistenz
Hebt etwaige unklare Regionen zur Expertenprüfung hervor

Datenanalyse und Bericht

Bericht mit vollständiger Annotation inkl. Sequenz und PTMs
Leucin/Isoleucin-Bestimmung durch spezielle Fragmentationsmuster

FAQ zu unserem De-novo-Antikörper-Protein-Sequenzierungsservice

Im Gegensatz zur klassischen Hybridom-Sequenzierung bestimmt die De-novo-Antikörper-Sequenzierung die Aminosäuresequenz eines Antikörpers ohne mRNA, DNA oder Hybridom-Zelllinie.
Durch die Analyse von Massendifferenzen der Fragmentionen lassen sich Peptidsequenzen rekonstruieren – die meisten Aminosäuren haben einzigartige Massen, sodass die Methode auch ohne genetische Informationen funktioniert.
Moderne MS/MS-Interpretation basiert auf Expertenanalyse oder fortschrittlichen Algorithmen (PEAKS, NOVOR). Herausforderungen sind etwa posttranslationale Modifikationen, Störsignale und fehlende Ionen – aktuelle Technologien machen den Prozess jedoch schnell, zuverlässig und hochgenau.
Dank neuester Massenspektrometrie garantiert ProteoGenix eine nahezu 100%ige Sequenzgenauigkeit, auch in CDR-Regionen.
- Sie benötigen keine Zelllinie. Ist das Hybridom verloren, kann der Antikörper dennoch gerettet werden.
- Posttranslationale Modifikationen werden erkannt – das ist mit DNA-Sequenzierung nicht möglich.
- Funktioniert für jeden Isotyp und jede Spezies.
- Eignet sich auch für Hochdurchsatz-Sequenzierungsprojekte.
Das macht diese Methode zu einer wertvollen Option, wenn Sie eine schnelle, praktische Alternative zur klassischen Hybridoma-Sequenzierung benötigen.
Ja. Wir setzen EThcD ein und kombinieren damit die Vorteile von ETD und HCD.
Dieser doppelte Ansatz ermöglicht:
- Doppelte Sequenzbestätigung
- Bessere Erhaltung posttranslationaler Modifikationen
- Überlegene Genauigkeit in komplexen Regionen wie CDR-H3
Selbstverständlich. ProteoGenix ist ein führender Anbieter für maßgeschneiderte Antikörperproduktion und nachgelagerte Antikörper-Engineering-Services. Wir begleiten Sie von der Expression bis zur funktionellen Optimierung.
Alle über unseren Antikörper-Protein-Sequenzierungsservice erhaltenen Sequenzen können über unsere rekombinante Antikörperproduktion exprimiert werden – entweder mittels transienter Expression oder durch maßgeschneiderte Zelllinienentwicklung für die langfristige Herstellung.
Zur weiteren Optimierung bieten wir außerdem:
Ob schnelle Expression, großtechnische Produktion oder fortgeschrittenes Engineering – unsere Plattform bietet einen durchgängigen Workflow von der Sequenzierung bis zum optimierten Antikörper.