Qu’est-ce que le séquençage de novo des protéines d’anticorps ?

Contrairement à un service classique de séquençage d’hybridome, le séquençage de novo détermine la séquence en acides aminés de l’anticorps sans besoin d’ARN messager, d’ADN ni de lignée cellulaire hybridome. En analysant les différences de masse entre les fragments ioniques, il devient possible de reconstruire les séquences peptidiques : la plupart des acides aminés ont des masses uniques, ce qui rend la démarche possible même sans information génétique. L’interprétation MS/MS moderne repose sur l’expertise ou des algorithmes avancés (PEAKS, NOVOR). Les défis subsistent (modifications post-traductionnelles, bruit, ions manquants), mais les dernières technologies permettent aujourd’hui des résultats rapides, fiables et très précis. Grâce aux progrès en spectrométrie de masse, ProteoGenix garantit une précision de séquence proche de 100 %, y compris dans les régions CDR.

Quels sont les avantages du séquençage protéique par rapport au séquençage ADN classique ?

Aucune lignée cellulaire requise. Si l’hybridome est perdu, l’anticorps reste récupérable. Les modifications post-traductionnelles sont détectées, ce qui est impossible avec le séquençage ADN. Compatible avec tous isotypes et espèces. Adapté aux projets de séquençage haut débit. Cette solution est idéale lorsqu’un service classique de séquençage d’hybridome n’est pas possible.

Combinez-vous plusieurs méthodes de fragmentation ?

Oui. Nous utilisons EThcD, qui combine les avantages de ETD et HCD. Cette double approche assure : Une double confirmation de la séquence Meilleure préservation des modifications post-traductionnelles Précision supérieure dans les régions complexes, comme la CDR-H3

Quelle quantité d’anticorps exigez-vous ?

Nous demandons généralement 50–100 μg d’anticorps à une pureté >80 %.

Une fois la séquence obtenue, pouvez-vous produire ou optimiser l’anticorps ?

Bien sûr. ProteoGenix est un spécialiste de la production d’anticorps sur mesure et des prestations en ingénierie de l’anticorps, intervenant à chaque étape de l’expression à l’optimisation fonctionnelle. Toutes les séquences obtenues via notre service de séquençage protéique peuvent être produites via notre plateforme de production recombinante d’anticorps, soit par expression transitoire soit via une lignée cellulaire stable pour la fabrication à long terme. Pour optimiser encore votre molécule, nous proposons aussi : Maturation d’affinité Humanisation d’anticorps Évaluation de développabilité Qu’il s’agisse d’une expression rapide, d’une production recombinante à grande échelle ou d’un haut niveau d’ingénierie, notre plateforme vous accompagne de la séquence à l’anticorps optimisé.

Service de séquençage de novo des protéines

Vous avez perdu votre hybridome ? Votre anticorps n’est pas perdu.

Sauvez votre anticorps maintenant

1 semaine

De l’anticorps purifié à la séquence

99 %

Taux de réussite

50 µg

Anticorps purifié requis

Perdre votre hybridome ne signifie pas perdre des années de travail. Avec seulement 50 μg d’anticorps purifié, notre service de séquençage de novo des anticorps peut récupérer votre séquence.

Une solution garantie pour sécuriser votre anticorps

Notre taux de réussite approche les 100 %. C’est pourquoi nous appliquons une règle claire : nous déterminons la séquence de votre anticorps, ou vous ne payez rien.

Je souhaite séquencer mon anticorps

Compatible avec tous les formats et espèces d’anticorps

Notre service de séquençage de novo des anticorps fonctionne pour tout isotype ou format : IgG, IgA, IgM, IgY, Fab, scFv, VHH, bispecifics, polyclonaux, provenant de souris, rat, lapin, camélidé et bien d’autres.

Production recombinante en option à des tarifs compétitifs

Vous pouvez associer le séquençage à notre plateforme de production recombinante d’anticorps. Cela vous permet de sécuriser la séquence et d’obtenir une version recombinante à un prix compétitif, le tout géré par un prestataire expérimenté.
Et encore une fois : si nous ne pouvons pas produire votre anticorps recombinant, vous ne payez aucun des deux services.

Je souhaite séquencer et produire mon anticorps

Notre service de séquençage des protéines d’anticorps en détail : de l’anticorps purifié à la séquence en 1 semaine

Digestion enzymatique de l’anticorps

Découpe l’anticorps en fragments peptidiques définis
Génère des peptides de taille optimale pour acquisition MS/MS
Assure une couverture complète des régions variables et constantes

LC-MS/MS

Sépare les peptides avant ionisation
Produit des spectres haute résolution pour chaque fragment
Capture les séries d’ions b/y et c/z pour une analyse robuste

Séquençage de novo des peptides

Reconstruit les séquences peptidiques directement à partir des spectres MS/MS
Valide la couverture par cohérence de recouvrement
Identifie les régions ambiguës pour relecture experte

Assemblage des peptides chevauchants

Reconstruit les séquences peptidiques à partir des spectres MS/MS
Vérifie la couverture par cohérence de recouvrement
Signale toute zone ambiguë pour validation experte

Analyse des données et rédaction du rapport

Remet un rapport complet et annoté, incluant séquence et PTMs
Détermine la leucine/isoleucine grâce à des signatures de fragmentation dédiées

FAQ concernant notre service de séquençage de novo des protéines d’anticorps

Contrairement à un service classique de séquençage d’hybridome, le séquençage de novo détermine la séquence en acides aminés de l’anticorps sans besoin d’ARN messager, d’ADN ni de lignée cellulaire hybridome.
En analysant les différences de masse entre les fragments ioniques, il devient possible de reconstruire les séquences peptidiques : la plupart des acides aminés ont des masses uniques, ce qui rend la démarche possible même sans information génétique.
L’interprétation MS/MS moderne repose sur l’expertise ou des algorithmes avancés (PEAKS, NOVOR). Les défis subsistent (modifications post-traductionnelles, bruit, ions manquants), mais les dernières technologies permettent aujourd’hui des résultats rapides, fiables et très précis.
Grâce aux progrès en spectrométrie de masse, ProteoGenix garantit une précision de séquence proche de 100 %, y compris dans les régions CDR.
- Aucune lignée cellulaire requise. Si l’hybridome est perdu, l’anticorps reste récupérable.
- Les modifications post-traductionnelles sont détectées, ce qui est impossible avec le séquençage ADN.
- Compatible avec tous isotypes et espèces.
- Adapté aux projets de séquençage haut débit.
Cette solution est idéale lorsqu’un service classique de séquençage d’hybridome n’est pas possible.
Oui. Nous utilisons EThcD, qui combine les avantages de ETD et HCD.
Cette double approche assure :
- Une double confirmation de la séquence
- Meilleure préservation des modifications post-traductionnelles
- Précision supérieure dans les régions complexes, comme la CDR-H3
Bien sûr. ProteoGenix est un spécialiste de la production d’anticorps sur mesure et des prestations en ingénierie de l’anticorps, intervenant à chaque étape de l’expression à l’optimisation fonctionnelle.
Toutes les séquences obtenues via notre service de séquençage protéique peuvent être produites via notre plateforme de production recombinante d’anticorps, soit par expression transitoire soit via une lignée cellulaire stable pour la fabrication à long terme.
Pour optimiser encore votre molécule, nous proposons aussi :
Qu’il s’agisse d’une expression rapide, d’une production recombinante à grande échelle ou d’un haut niveau d’ingénierie, notre plateforme vous accompagne de la séquence à l’anticorps optimisé.