Cos’è il de novo sequencing proteico degli anticorpi?

A differenza di un classico servizio di sequencing di ibridomi, il de novo sequencing consente di determinare la sequenza amminoacidica di un anticorpo senza necessità di mRNA, DNA o una linea cellulare ibridoma. Analizzando le differenze di massa tra ioni dei frammenti, è possibile ricostruire le catene peptidiche – la maggior parte degli amminoacidi ha masse uniche, rendendo il processo fattibile anche senza dati genetici. L’interpretazione degli spettri MS/MS attuali si basa su analisi da parte di esperti o algoritmi avanzati (PEAKS, NOVOR). Pur esistendo alcune sfide (modifiche post-traduzionali, rumore, ioni mancanti), le tecnologie più avanzate rendono ora il processo rapido, affidabile e preciso. Grazie agli ultimi sviluppi nella spettrometria di massa, ProteoGenix garantisce quasi il 100% di accuratezza della sequenza, incluse le regioni CDR.

Quali sono i vantaggi del sequencing proteico rispetto a quello classico su DNA?

Non è necessaria una linea cellulare. Se l’ibridoma è perso, l’anticorpo può comunque essere recuperato. Le modifiche post-traduzionali vengono rilevate, a differenza del sequencing su DNA. Funziona per qualsiasi isotipo e specie. Ideale per progetti di sequencing ad alto rendimento. Rende quindi questa opzione preziosa quando si cerca una soluzione pratica, veloce e alternativa a un tipico servizio di sequencing di ibridomi.

Utilizzate diversi metodi di frammentazione?

Sì. Utilizziamo EThcD, che combina i vantaggi di ETD e HCD. Questo approccio offre: Doppia conferma della sequenza Migliore conservazione delle modifiche post-traduzionali Maggiore accuratezza in regioni complesse come CDR-H3

Quanta quantità di anticorpo serve?

In genere sono necessari 50–100 μg di anticorpo a >80% di purezza.

Una volta ottenuta la sequenza, potete produrre o ottimizzare l’anticorpo?

Certamente. ProteoGenix è un leader nella produzione personalizzata di anticorpi e nei servizi downstream di ingegneria anticorpale, supportando ogni fase dall’espressione all’ottimizzazione funzionale. Tutte le sequenze ottenute tramite il servizio di sequencing proteico degli anticorpi possono essere prodotte utilizzando i nostri servizi di produzione ricombinante, sia tramite espressione transiente che sviluppo di linee cellulari stabili per la produzione su larga scala. Per perfezionare ulteriormente la molecola, offriamo anche: affinità maturazione dell’anticorpo servizi di umanizzazione degli anticorpi valutazione della developability Che abbia bisogno di espressione rapida, produzione ricombinante su larga scala o ingegnerizzazione avanzata, la nostra piattaforma offre workflow completi e coerenti dal sequencing agli anticorpi ottimizzati.

Servizio di sequencing proteico degli anticorpi

Ha perso il suo ibridoma? Il suo anticorpo non è andato perso.

Salva ora il tuo anticorpo

0 settimana

Da anticorpo purificato a sequenza

Tasso di successo

0 µg

Anticorpo purificato richiesto

Perdere il suo ibridoma non significa perdere anni di lavoro. Con solo 50 μg di anticorpo purificato, il nostro servizio di de novo sequencing degli anticorpi può recuperare la sua sequenza.

Un modo garantito per mettere al sicuro il suo anticorpo

Il nostro tasso di successo è vicino al 100%. Per questo applichiamo una regola chiara: determiniamo la sequenza del suo anticorpo, oppure non paga nulla.

Voglio sequenziare il mio anticorpo

Compatibile con tutti i formati e specie anticorpali

Il nostro servizio di de novo sequencing copre ogni isotipo o formato: IgG, IgA, IgM, IgY, Fab, scFv, VHH, bispecifici, policlonali, da topo, ratto, coniglio, camelide e molti altri.

Produzione ricombinante opzionale a tariffe competitive

Può abbinare il sequencing alla nostra piattaforma di produzione ricombinante degli anticorpi. Così potrà mettere in sicurezza la sequenza e ottenere una versione ricombinante a un prezzo competitivo da un unico partner esperto.
E ancora: se non riusciamo a produrre il suo anticorpo ricombinante, non paga nulla per nessuno dei due passaggi.

Voglio sequenziare e produrre il mio anticorpo

Il nostro servizio di sequencing anticorpale in dettaglio: da anticorpo purificato a sequenza in 1 settimana

Da anticorpo purificato a sequenza in 1 settimana

Digestione enzimatica dell’anticorpo

Taglia l’anticorpo in frammenti peptidici definiti
Genera peptidi di dimensioni ottimali per l’analisi MS/MS
Assicura la copertura completa delle regioni variabili e costanti

LC-MS/MS

Separa i peptidi prima della ionizzazione
Produce spettri ad alta risoluzione per ogni frammento
Acquisisce serie di ioni b/y e c/z per analisi robuste

Sequenziamento de novo dei peptidi

Ricostruisce le sequenze peptidiche direttamente dagli spettri MS/MS
Convalida la copertura tramite la coerenza degli overlap
Evidenzia eventuali regioni ambigue per la revisione esperta

Assemblaggio dei peptidi sovrapposti

Ricostruisce le sequenze peptidiche direttamente dagli spettri MS/MS
Convalida la copertura tramite la coerenza degli overlap
Evidenzia eventuali regioni ambigue per la revisione esperta

Analisi dati e redazione del report

Fornisce un report completo e annotato comprensivo di sequenza e PTM
Determina leucina/isoleucina con firme di frammentazione dedicate

Domande frequenti sul nostro servizio di de novo sequencing proteico degli anticorpi

A differenza di un classico servizio di sequencing di ibridomi, il de novo sequencing consente di determinare la sequenza amminoacidica di un anticorpo senza necessità di mRNA, DNA o una linea cellulare ibridoma.
Analizzando le differenze di massa tra ioni dei frammenti, è possibile ricostruire le catene peptidiche – la maggior parte degli amminoacidi ha masse uniche, rendendo il processo fattibile anche senza dati genetici.
L’interpretazione degli spettri MS/MS attuali si basa su analisi da parte di esperti o algoritmi avanzati (PEAKS, NOVOR). Pur esistendo alcune sfide (modifiche post-traduzionali, rumore, ioni mancanti), le tecnologie più avanzate rendono ora il processo rapido, affidabile e preciso.
Grazie agli ultimi sviluppi nella spettrometria di massa, ProteoGenix garantisce quasi il 100% di accuratezza della sequenza, incluse le regioni CDR.
- Non è necessaria una linea cellulare. Se l’ibridoma è perso, l’anticorpo può comunque essere recuperato.
- Le modifiche post-traduzionali vengono rilevate, a differenza del sequencing su DNA.
- Funziona per qualsiasi isotipo e specie.
- Ideale per progetti di sequencing ad alto rendimento.
Rende quindi questa opzione preziosa quando si cerca una soluzione pratica, veloce e alternativa a un tipico servizio di sequencing di ibridomi.
Sì. Utilizziamo EThcD, che combina i vantaggi di ETD e HCD.
Questo approccio offre:
- Doppia conferma della sequenza
- Migliore conservazione delle modifiche post-traduzionali
- Maggiore accuratezza in regioni complesse come CDR-H3
Certamente. ProteoGenix è un leader nella produzione personalizzata di anticorpi e nei servizi downstream di ingegneria anticorpale, supportando ogni fase dall’espressione all’ottimizzazione funzionale.
Tutte le sequenze ottenute tramite il servizio di sequencing proteico degli anticorpi possono essere prodotte utilizzando i nostri servizi di produzione ricombinante, sia tramite espressione transiente che sviluppo di linee cellulari stabili per la produzione su larga scala.
Per perfezionare ulteriormente la molecola, offriamo anche:
Che abbia bisogno di espressione rapida, produzione ricombinante su larga scala o ingegnerizzazione avanzata, la nostra piattaforma offre workflow completi e coerenti dal sequencing agli anticorpi ottimizzati.