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Rapport de cas

Ingénierie de sept formats d’anticorps bispécifiques conduisant à des leads nanomolaires contre le cancer de la prostate

 

Télécharger le rapport de cas complet Parlez à nos experts

  • Client

    Entreprise biotech suédoise

     

    Secteur

    Thérapeutique

  • Domaine de recherche

    Oncologie

     

    Maladie cible

    Cancer de la prostate

  • Processus clés

    • Choix et conception du format bispécifique
    • Expression et purification
    • Caractérisation par ELISA et Biacore
7
Formats bispécifiques conçus
3,2x10⁻¹⁰ M
Affinité du meilleur candidat bispécifique

Contexte

Une entreprise biotech suédoise a confié à ProteoGenix la conception et la production de divers formats d’anticorps bispécifiques. Le client a fourni les séquences de deux anticorps monoclonaux, nommés Ab1 et Ab2, qui ont servi de base à l’ingénierie des anticorps bispécifiques.

Pour optimiser le potentiel thérapeutique de ces anticorps parentaux, sept formats bispécifiques distincts ont été sélectionnés pour la conception et le développement par nos experts :

  • Ab1-Ab2-KIH
  • Ab1-Ab2-DEKK
  • Ab1-Ab2-CrossMAb-KIH
  • Ab1-Ab2-CrossMAb-DEKK
  • Ab1-Ab2-DuetMab-KIH
  • Ab1-Ab2-DuetMab-DEKK
  • Ab1-Ab2-Duobody

Cette approche multi-format conçue par nos experts a permis une évaluation complète de différentes architectures moléculaires afin d’identifier le ou les candidats les plus adaptés pour un développement ultérieur.

Défis

1

Exprimer les sept anticorps bispécifiques avec une bonne assemblage

2

Conserver l’affinité des anticorps bispécifiques générés dans la même gamme que les anticorps parentaux

Approche ProteoGenix

  1. Gènes codant pour les protéines cibles
  • cADN synthétisés chimiquement avec optimisation des codons pour l’expression dans les cellules de mammifères

2. Subclonage dans le vecteur d’expression

  • Les séquences cADN ont été subclonées dans le vecteur propriétaire d’expression de cellules de mammifères pTXs1 de ProteoGenix. Au total, 14 plasmides d’expression ont été utilisés pour ce projet.

3. Tests d’expression et de purification des anticorps bispécifiques recombinants

  • La purification d’ADN sans endotoxine a été réalisée pour chaque construction d’expression pTXs1.
  • Co-transfection transitoire dans des cellules XtenCHOTM propriétaires
  • Purification sur une résine protéine G par une méthode standard
  • Détermination des rendements après purification et échange de tampon par méthode UV280

4. Réaction post-production pour un format IgG-like en utilisant Duobodies

  • Ab1-Duobody et Ab2-Duobody ont été recombinés par échange contrôlé de bras Fab dirigé par des mutations appariées sous conditions de laboratoire adaptées
  • L’évaluation générale de la qualité des anticorps bispécifiques générés a ensuite été réalisée par SDS-PAGE

5. Caractérisation des différents formats bispécifiques

  • Titration ELISA de la capacité de liaison des anticorps bispécifiques à Ag1 et Ag2. Les anticorps parentaux Ab1 et Ab2 ont également été testés en comparaison.
  • La détermination de KD a été réalisée via Biacore T200 pour évaluer la capacité de liaison des formats bispécifiques à Ag1 et Ag2 par rapport aux anticorps parentaux. Les trois meilleurs formats bispécifiques de l’étape précédente ont été sélectionnés pour la détermination du KD : Ab1-Ab2-Duobody, Ab1-Ab2-KIH et Ab1-Ab2-CrossMAb-KIH.

Résultats

Les analyses SDS-PAGE des profils de purification et des contrôles qualité (QC) finaux ont montré que les formats Ab1-Ab2-DEKK et Ab1-Ab2-DuetMab-DEKK s’expriment mais ne s’assemblent pas en structures d’anticorps bispécifiques complètes, probablement en raison d’un manque d’hétérodimérisation des chaînes lourdes. La mutation DEKK ne semble donc pas être un format bispécifique optimal pour ce couple Ab1/Ab2 spécifique. Tous les autres formats bispécifiques et les Duobodies simples ont pu être exprimés avec de bons rendements et une bonne pureté, et correctement assemblés en structures complètes d’anticorps.

Chaque anticorps bispécifique testé a pu se lier aux antigènes, bien que les deux formats DEKK (Ab1-Ab2-DEKK et Ab1-Ab2-DuetMab-DEKK) aient montré une liaison très faible, ce qui est cohérent avec leur mauvais assemblage. Par rapport aux anticorps parentaux Ab1 et Ab2, les meilleurs anticorps bispécifiques en termes de liaison sont Ab1-Ab2-Duobody, Ab1-Ab2-KIH et Ab1-Ab2-CrossMAb-KIH, suggérant que ces constructions bispécifiques ont conservé leur capacité de liaison.

Les résultats de la détermination du KD sont cohérents avec les titrations ELISA réalisées ci-dessus. La liaison des trois anticorps bispécifiques testés est confirmée contre chaque antigène avec une haute affinité dans la gamme nanomolaire. Une différence d’affinité peut être notée pour tous les anticorps bispécifiques par rapport aux anticorps parentaux, ce qui s’explique par une avidité réduite car l’anticorps parental possède deux sites de liaison à l’antigène contrairement aux bispécifiques qui sont monovalents pour chaque antigène.

Point clé à retenir

Les sept formats d’anticorps bispécifiques choisis ont été conçus et exprimés avec succès contre deux cibles du cancer de la prostate, avec cinq formats obtenant un assemblage correct et une double liaison antigénique.

Trois meilleurs candidats — Duobody, KIH, et CrossMAb-KIH — ont été validés par Biacore pour conserver une affinité nanomolaire pour les deux antigènes, avec le meilleur candidat à 3,20×10⁻¹⁰ M.

Cela démontre que le criblage multi-format est une stratégie efficace pour identifier des leads d’anticorps bispécifiques à haute affinité tout en évitant les écueils d’assemblage comme observé pour les formats DEKK.

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