Services de Cartographie d’Épitope

Nous utilisons une méthodologie unique associant nos propres modèles IA et des méthodes de docking pour prédire les zones d’acides aminés de l’antigène susceptibles d’être reconnues par l’anticorps (ainsi que l’interface anticorps du côté opposé). Nous pouvons générer ~10⁹ poses de docking et fournir les 30 meilleures solutions.

Une combinaison. Nous pouvons cartographier directement sur séquences ou utiliser des structures fournies par le client ou issues du public.

Les épitopes peuvent être linéaires (séquence continue) ou conformationnels (résidus éloignés rapprochés en 3D). Notre approche prédit des zones d’acides aminés et tire parti des structures 3D, pour couvrir les deux types d’épitopes.

Au minimum, nous pouvons travailler à partir de séquences. Si disponible, nous utilisons également des structures client ou publiques. Nous vous demandons autant que possible d’informations biologiques amont pour garantir la cohérence des résultats.

Oui — nous pouvons identifier les régions d’épitope sans données expérimentales ni publications préalables.

Notre service de cartographie d’épitope s’adapte à la découverte d’anticorps thérapeutiques, la production d’anticorps diagnostics, et aux anticorps de recherche.

Le délai moyen est d’environ 2 semaines.

Nous fournissons une cartographie épitope & paratope incluant les résidus ou zones d’acides aminés prédits comme impliqués à l’interface. Nous pouvons également caractériser le type d’interactions (hydrophobe, pont H, sel, Van der Waals, etc.) et suggérer des mutations pour neutraliser ou renforcer les interactions. Nous convergeons généralement sur une épitope fiable de ~10 résidus clés après itération.

Nous recommandons la validation ciblée : introduire des mutations sur les régions prédites, synthétiser des gènes pour chaque variante, les produire par recombinaison, puis confirmer expérimentalement par cytométrie en flux. Une deuxième série de mutations peut être menée pour valider définitivement les prédictions d’épitope/paratope.

HDX-MS est disponible, mais cette méthode est nettement plus coûteuse et moins fiable pour les protéines désordonnées en raison de l’échange rapide du deutérium.

Bien sûr, nous vous accompagnons grâce à notre gamme de services d’ingénierie anticorps incluant : affinité IA, humanisation IA et développabilité IA.

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