Wie identifiziert und prognostiziert Ihr KI-Modell Antikörper-Epitope?

Wir verwenden eine einzigartige Pipeline, die eigene KI-Modelle und dockingsbasierte Methoden kombiniert, um die Aminosäure-Patches auf dem Antigen vorherzusagen, auf die der Antikörper wahrscheinlich abzielt (und die korrespondierende Antikörper-Oberfläche). Wir können ~10⁹ Docking-Posen generieren und die Top-30-Posen liefern.

Erfolgt das Epitope Mapping auf Basis von Sequenzdaten, Strukturmodellierung oder beidem?

Eine Kombination. Wir können direkt aus Sequenzen mappen oder vom Kunden bereitgestellte/öffentliche Strukturen nutzen.

Kann die KI zwischen linearen und konformationellen Epitopen unterscheiden?

Epitope können linear (fortlaufende Sequenz) oder konformationell (räumlich zusammengeführte, entfernte Reste) sein. Unsere Methode prognostiziert Aminosäure-Patches und nutzt 3D-Strukturen, um beide Epitope-Typen zu unterstützen.

Welche Eingabedaten benötigen Sie (Antikörpersequenz, Antigensequenz, Strukturdaten)?

Wir können mindestens mit Sequenzen arbeiten. Falls vorhanden, können auch vom Kunden bereitgestellte oder öffentliche Strukturen genutzt werden. Zudem bitten wir um möglichst umfangreiche biologische Informationen im Vorfeld, um Konsistenz zwischen Kundendaten und unseren Ergebnissen sicherzustellen.

Kann Epitope Mapping bereits in der Frühphase (vor experimenteller Charakterisierung) durchgeführt werden?

Ja – wir können Epitope ohne Vorwissen aus Experimenten oder Publikationen identifizieren.

Ist der Ansatz für therapeutische, diagnostische oder Forschungsantikörper geeignet?

Unser Epitope Mapping Service eignet sich für die Entwicklung therapeutischer Antikörper, die Herstellung diagnostischer Antikörper und Forschung.

Wie lange dauert der Service im Durchschnitt?

Die durchschnittliche Bearbeitungszeit liegt bei etwa 2 Wochen.

Welcher Output wird bereitgestellt (Epitope-Regionen, Residue-Vorhersagen, Vertrauenswert)?

Wir liefern Epitope- & Paratope-Mapping mit prognostizierten Aminosäure-Patches/Residuen an der Interaktionsstelle. Wir können Interaktionstypen charakterisieren (hydrophob, H-Brücken, Salzbrücken, Van-der-Waals, etc.) und Mutationen vorschlagen zur Neutralisierung oder Optimierung. Nach Iteration liegt das Epitope typischerweise bei ~10 Schlüsselresiduen.

Wie empfehlen Sie, die KI-Vorhersagen experimentell zu validieren?

Wir empfehlen eine zielgerichtete Validierung: Mutationen in den prognostizierten Regionen einführen, Gene synthetisieren für jede Variante, rekombinant exprimieren und anschließend in Durchflusszytometrie prüfen. Eine zweite Mutationsrunde kann zur endgültigen Bestätigung des vorhergesagten Epitops/Paratops erfolgen. HDX-MS ist verfügbar, jedoch deutlich kostenintensiver und weniger zuverlässig bei Proteinen mit unstrukturierten Bereichen (aufgrund des schnellen Deuteriumaustausches).

Ist der Service mit Affinitätsmaturation, Humanisierung oder Developability-Workflows kompatibel?

Selbstverständlich unterstützen wir Sie mit unserem umfassenden Angebot an Antikörper-Engineering-Services, darunter: KI-gesteuerte Affinitätsmaturation, KI-gestützte Humanisierung und KI-gestützte Developability-Optimierung. Entdecken Sie unsere Services zur Antikörper-Optimierung

Wem gehören die Mapping-Daten und generierten Erkenntnisse?

Sie bleiben uneingeschränkter Eigentümer Ihres Antikörpers. Unser Service ist 100% IP-frei, gebührenfrei und ohne Einschränkungen.

Kann KI-Epitope Mapping in langfristige Entdeckungs-/Entwicklungsprogramme integriert werden?

Ja. Ihr persönlicher PhD-Experte begleitet Sie durchgehend. Unsere therapeutischen Antikörper-Discovery-Services führen Sie von der frühen Entdeckung bis zur präklinischen Produktion und individuellen Zelllinienentwicklung.

Fast-track your project, get insight on your antibody’s binding in 2 weeks

Epitope Mapping Dienstleistungen

Beschleunigen Sie Ihr Projekt – erhalten Sie Einblicke in die Bindung Ihres Antikörpers in 2 Wochen

Kontaktieren Sie uns Sprechen Sie mit unseren Experten

Wochen Bearbeitungszeit

10⁹

Docking-Posen analysiert

10Bn

Sequenzen in unserer proprietären KI

KI-gesteuertes Epitope Mapping für zuverlässigere Bindungsanalysen

Sprechen Sie mit einem Experten

Die Erkenntnisse, die Sie brauchen für Ihren nächsten Schritt

Identifizieren Sie Schlüsselresiduen für Ihre Designstrategie

Sie erhalten einen umfassenden Bericht mit den wichtigsten Bindungsresiduen aus den Top 30 Docking-Lösungen. Diese Daten helfen Ihnen, Ihre Designstrategie gezielt zu steuern und zu optimieren.
Höhere Zuverlässigkeit durch KI-unterstütztes Epitope Mapping

Unsere proprietäre KI analysiert bis zu 10⁹ Docking-Posen, um statistisch signifikante Epitope zu bestimmen. So verringern Sie Unsicherheiten und reduzieren experimentelles Rätselraten. Docking im großen Maßstab ermöglicht eine sichere Epitope-Mapping sogar bei komplexen Antikörper-Antigen-Interaktionen.
2 Wochen Epitope Mapping für schnellere Forschungsentscheidungen

In nur 2 Wochen erhalten Sie robuste Epitope-Mapping-Daten, die Ihnen frühe Forschungsentscheidungen ermöglichen und Sie zuverlässig in die Weiterentwicklung führen.
All-in-One Epitope- und Paratope-Mapping

Da sowohl Epitope Mapping als auch Paratope Mapping in einer Dienstleistung enthalten sind, erhalten Sie einen umfassenden und handlungsorientierten Überblick über die Antikörper-Antigen-Interaktion.

Fachkundige Begleitung bei jedem Schritt

Strategic Guidance Powered by AI and Expertise

Strategische Begleitung durch KI & Expertenwissen

Unser Service geht über KI-gestützte Analysen hinaus: Bioinformatik-Experten interpretieren die Ergebnisse, erläutern deren Bedeutung für Ihr spezielles Projekt und begleiten Sie bei jedem Schritt. Alle Analysedaten werden in klare, umsetzbare Erkenntnisse übersetzt – damit Sie Ihre Designstrategie gezielt weiterentwickeln können.

Erhalten Sie Einblicke in das Epitope Ihres Antikörpers

Boost Binding Performance with our AI-driven Affinity Maturation service

Bindungsleistung steigern mit unserem KI-gestützten Affinitätsmaturation-Service

Sobald Ihr Epitope und Paratope identifiziert wurden, wandeln unsere promovierten Wissenschaftler und Bioinformatiker diese Charakterisierungsergebnisse in eine gezielte Strategie zur Affinitätsmaturation um, um die Bindung zu verstärken und die Leistung zu verbessern.

Entdecken Sie unseren KI-gestützten Affinitätsmaturation-Service

Strengthen Antibody Patents with our Epitope and Paratope Mapping service

Antikörper-Patente stärken mit unserem Epitope- und Paratope-Mapping

Unsere Beratung reicht bis zur Patentstrategie: Da weit gefasste Bindungsansprüche in den USA nicht mehr zulässig sind, bietet KI-gestütztes Epitope- und Paratope-Mapping eine solide Basis für Antikörperpatente. Die Definition durch gemeinsame Paratope-Residuen und tolerierte CDR-Variationen unterstützt belastbare und verteidigungsfähige IP-Ansprüche.

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Ressource

Fallstudie: Von KI-Vorhersage zum experimentellen Nachweis – 85% Signalreduktion mit AIxplore® Epitope & Paratope Mapping

So funktioniert es

FAQ

Wir verwenden eine einzigartige Pipeline, die eigene KI-Modelle und dockingsbasierte Methoden kombiniert, um die Aminosäure-Patches auf dem Antigen vorherzusagen, auf die der Antikörper wahrscheinlich abzielt (und die korrespondierende Antikörper-Oberfläche). Wir können ~10⁹ Docking-Posen generieren und die Top-30-Posen liefern.
Wir können mindestens mit Sequenzen arbeiten. Falls vorhanden, können auch vom Kunden bereitgestellte oder öffentliche Strukturen genutzt werden. Zudem bitten wir um möglichst umfangreiche biologische Informationen im Vorfeld, um Konsistenz zwischen Kundendaten und unseren Ergebnissen sicherzustellen.
Wir liefern Epitope- & Paratope-Mapping mit prognostizierten Aminosäure-Patches/Residuen an der Interaktionsstelle. Wir können Interaktionstypen charakterisieren (hydrophob, H-Brücken, Salzbrücken, Van-der-Waals, etc.) und Mutationen vorschlagen zur Neutralisierung oder Optimierung. Nach Iteration liegt das Epitope typischerweise bei ~10 Schlüsselresiduen.
Wir empfehlen eine zielgerichtete Validierung: Mutationen in den prognostizierten Regionen einführen, Gene synthetisieren für jede Variante, rekombinant exprimieren und anschließend in Durchflusszytometrie prüfen. Eine zweite Mutationsrunde kann zur endgültigen Bestätigung des vorhergesagten Epitops/Paratops erfolgen.

HDX-MS ist verfügbar, jedoch deutlich kostenintensiver und weniger zuverlässig bei Proteinen mit unstrukturierten Bereichen (aufgrund des schnellen Deuteriumaustausches).
Selbstverständlich unterstützen wir Sie mit unserem umfassenden Angebot an Antikörper-Engineering-Services, darunter: KI-gesteuerte Affinitätsmaturation, KI-gestützte Humanisierung und KI-gestützte Developability-Optimierung.

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