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Informe de caso:

Aceleración del desarrollo de diagnóstico neurológico con maduración de afinidad de anticuerpos impulsada por IA

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  • Cliente

    Industria farmacéutica

    Sector

    Diagnóstico

  • Área de investigación

    Neurología

  • Procesos clave

    • AIxplore-Interactions para identificar regiones CDR
    • Herramientas de IA para mutaciones estratégicas
    • SDS-page, ELISA titración, BLI para probar capacidad de unión

Números clave

1,99x10⁻¹⁰ M
Afinidad del anticuerpo principal (validación BLI)
Hasta 20
veces de mejora
2
Ciclos iterativos de aprendizaje

Contexto

Una empresa farmacéutica identificó un anticuerpo prometedor para el diagnóstico de enfermedades neurodegenerativas, pero su sensibilidad era insuficiente para una detección confiable. El objetivo del proyecto fue aumentar la afinidad de unión de un anticuerpo murino dirigido a un antígeno humano, con el fin de acelerar el desarrollo y avanzar rápidamente hacia una solución diagnóstica robusta.

Para reducir riesgos y optimizar la estrategia, primero realizamos un mapeo paratope–epítopo detallado para clarificar la interfaz de interacción y guiar un diseño más racional de variantes mejoradas en afinidad. Sobre esta base, empleamos nuestro servicio de maduración de afinidad para generar y evaluar variantes optimizadas de anticuerpos, seleccionando las opciones mejoradas con mayor unión al objetivo.

Desafíos

1

Asegurar desarrollabilidad manteniendo niveles de expresión al menos comparables al WT

 

2

Mantener la estabilidad estructural principal a pesar de los cambios de secuencia

 

3

Acercarse al máximo posible al umbral de rendimiento

 

4

Mejorar afinidad sin aumentar la unión inespecífica

 

Enfoque ProteoGenix

Nuestro proceso consiste en diseñar mutaciones dirigidas para potenciar las interacciones anticuerpo-antígeno, teniendo en cuenta los desafíos específicos de cada proyecto.

  1. Diseño de variantes guiado por IA

Utilizamos nuestra plataforma de IA para proponer sustituciones específicas de aminoácidos y seleccionamos 20 variantes de anticuerpos para diseñar y evaluar.

2. Revisión biológica

Revisamos y desafiamos sistemáticamente las sustituciones generadas por IA junto a nuestro equipo de bioinformática para asegurar la relevancia biológica de cada variante y su alineación con los requisitos de destino.

3. Validación en laboratorio

Expresamos y purificamos las variantes predichas, validando la unión mediante SDS-PAGE, ELISA de titulación y BLI, para obtener métricas empíricas de afinidad y seleccionar los mejores candidatos.

4. Ciclo de aprendizaje iterativo

Resultados experimentales se retroalimentan en nuestros modelos de IA, permitiendo iteraciones de diseño-prueba rápidas y una convergencia más ágil hacia candidatos líderes con mejor afinidad.

Resultados

Identificamos con éxito una variante principal de anticuerpo (Ab-1) con una mejora de afinidad de aproximadamente 20 veces respecto al anticuerpo parental (WT), además de variantes adicionales (Ab-2 a Ab-5) que mostraron aumentos de 2 a 10 veces en afinidad frente a WT.

Las mediciones cinéticas muestran que la maduración de afinidad no comprometió el rendimiento inicial del anticuerpo y mantuvo la desarrollabilidad. Además, el análisis estructural 3D combinado con nuestra herramienta de IA confirmó la estabilidad estructural principal.

 

 

 

Conclusión clave

El cliente obtuvo variantes de anticuerpos con hasta 20 veces mayor afinidad respecto al parental, permitiendo avanzar con rapidez y confianza a la siguiente etapa.

Nuestro método de maduración de afinidad potenciada por IA predice e introduce mutaciones dirigidas para mejorar la unión al antígeno preservando siempre la desarrollabilidad del anticuerpo. 

 

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