Qu’est-ce que le séquençage protéique d’anticorps de novo ?

Contrairement à un séquençage classique d’hybridome, le séquençage de novo détermine la séquence d’acides aminés d’un anticorps sans nécessiter d’ARNm, d’ADN ou de lignée cellulaire hybridome. En analysant les différences de masse entre fragments ioniques, il devient possible de reconstruire les séquences peptidiques — la plupart des acides aminés ayant des masses uniques, le processus reste possible même sans information génétique. L’interprétation MS/MS moderne repose sur l’expertise ou sur des algorithmes avancés (PEAKS, NOVOR). Malgré des défis (modifications post-traductionnelles, bruit, ions manquants), les technologies actuelles rendent le processus rapide, fiable et extrêmement précis. Grâce aux dernières avancées en spectrométrie de masse, ProteoGenix garantit une précision de séquence proche de 100 %, y compris dans les régions CDR.

Quels sont les avantages du séquençage protéique par rapport au séquençage d’ADN classique ?

Vous n’avez pas besoin d’une lignée cellulaire. En cas de perte d’hybridome, l’anticorps reste accessible. Les modifications post-traductionnelles sont détectées (impossible en séquençage d’ADN). Fonctionne pour tout isotype, toute espèce. Adapté aux projets de séquençage à haut débit. Cela en fait une solution de choix pour remplacer rapidement le séquençage hybride traditionnel.

Combinez-vous plusieurs méthodes de fragmentation ?

Oui. Nous utilisons EThcD, qui allie la puissance d’ETD et de HCD. Cette approche double permet : Double confirmation des séquences Meilleure préservation des modifications post-traductionnelles Excellente précision dans les régions complexes comme la CDR-H3

Quelle quantité d’anticorps faut-il fournir ?

Nous demandons en général 50–100 μg d’anticorps à une pureté >80 %.

Une fois la séquence établie, pouvez-vous produire ou optimiser l’anticorps ?

Bien sûr. ProteoGenix est spécialiste de la production sur-mesure d’anticorps et de l’ingénierie en aval, de l’expression à l’optimisation fonctionnelle. Toutes les séquences issues de notre service de séquençage peuvent être produites via notre plateforme de production d’anticorps recombinants, par expression transitoire ou via développement de lignée cellulaire. Pour aller plus loin, nous proposons aussi : Optimisation d’affinité Humanisation d’anticorps Analyse de développabilité Besoin d’expression rapide, de production à grande échelle ou d’ingénierie avancée ? Notre plateforme accompagne chaque étape jusqu’aux anticorps optimisés.

Service de séquençage protéique d’anticorps

Vous avez perdu votre hybridome ? Votre anticorps n’est pas perdu.

Sauvez votre anticorps maintenant

0 semaine

Du purifié à la séquence

0 %

Taux de réussite

0 µg

Anticorps purifié requis

Perdre votre hybridome ne signifie pas perdre des années de travail. Avec seulement 50 μg d’anticorps purifié, notre service de séquençage d’anticorps récupère votre séquence.

Une méthode garantie pour sécuriser votre anticorps

Notre taux de réussite est proche de 100 %. C’est pourquoi nous avons une règle claire : nous déterminons la séquence de votre anticorps, ou vous ne payez rien.

Je veux séquencer mon anticorps

Compatible avec tous les formats et espèces d’anticorps

Notre service de séquençage de novo fonctionne quel que soit l’isotype ou le format : IgG, IgA, IgM, IgY, Fab, scFv, VHH, bispecifics, polyclonaux, provenant de souris, rat, lapin, camélidé et bien d’autres.

Production recombinante en option à des tarifs compétitifs

Vous pouvez associer le séquençage à notre plateforme de production d’anticorps recombinants. Vous sécurisez ainsi la séquence et obtenez une version recombinante à un prix compétitif, le tout géré par un prestataire expérimenté.
Et encore : si nous ne pouvons pas produire votre anticorps recombinant, vous ne payez rien pour l’une ou l’autre étape.

Je veux séquencer et produire mon anticorps

Notre service de séquençage d’anticorps en détail : du purifié à la séquence en 1 semaine

Du purifié à votre séquence en 1 semaine

Digestion enzymatique de l’anticorps

Clive l’anticorps en fragments peptidiques définis
Génère des peptides de tailles optimales pour l’acquisition MS/MS
Garantit une couverture complète des régions variables et constantes

LC-MS/MS

Sépare les peptides avant ionisation
Produit des spectres haute résolution pour chaque fragment
Capture les séries d’ions b/y et c/z pour une analyse robuste

Séquençage de peptides de novo

Reconstruit les séquences peptidiques directement à partir des spectres MS/MS
Valide la couverture par cohérence d’overlap
Signale les régions ambiguës pour une revue experte

Assemblage des peptides chevauchants

Reconstruit les séquences peptidiques directement à partir des spectres MS/MS
Valide la couverture par cohérence d’overlap
Signale les régions ambiguës pour une revue experte

Analyse des données et rédaction du rapport

Fournit un rapport annoté incluant la séquence et les modifications post-traductionnelles (PTM)
Détermine la leucine/isoleucine grâce à des signatures de fragmentation dédiées

FAQ sur notre service de séquençage protéique d’anticorps de novo

Contrairement à un séquençage classique d’hybridome, le séquençage de novo détermine la séquence d’acides aminés d’un anticorps sans nécessiter d’ARNm, d’ADN ou de lignée cellulaire hybridome.
En analysant les différences de masse entre fragments ioniques, il devient possible de reconstruire les séquences peptidiques — la plupart des acides aminés ayant des masses uniques, le processus reste possible même sans information génétique.
L’interprétation MS/MS moderne repose sur l’expertise ou sur des algorithmes avancés (PEAKS, NOVOR). Malgré des défis (modifications post-traductionnelles, bruit, ions manquants), les technologies actuelles rendent le processus rapide, fiable et extrêmement précis.
Grâce aux dernières avancées en spectrométrie de masse, ProteoGenix garantit une précision de séquence proche de 100 %, y compris dans les régions CDR.
- Vous n’avez pas besoin d’une lignée cellulaire. En cas de perte d’hybridome, l’anticorps reste accessible.
- Les modifications post-traductionnelles sont détectées (impossible en séquençage d’ADN).
- Fonctionne pour tout isotype, toute espèce.
- Adapté aux projets de séquençage à haut débit.
Cela en fait une solution de choix pour remplacer rapidement le séquençage hybride traditionnel.
Oui. Nous utilisons EThcD, qui allie la puissance d’ETD et de HCD.
Cette approche double permet :
- Double confirmation des séquences
- Meilleure préservation des modifications post-traductionnelles
- Excellente précision dans les régions complexes comme la CDR-H3
Bien sûr. ProteoGenix est spécialiste de la production sur-mesure d’anticorps et de l’ingénierie en aval, de l’expression à l’optimisation fonctionnelle.
Toutes les séquences issues de notre service de séquençage peuvent être produites via notre plateforme de production d’anticorps recombinants, par expression transitoire ou via développement de lignée cellulaire.
Pour aller plus loin, nous proposons aussi :
Besoin d’expression rapide, de production à grande échelle ou d’ingénierie avancée ? Notre plateforme accompagne chaque étape jusqu’aux anticorps optimisés.