L’intelligence artificielle rencontre le wet lab

Ce que l’IA apporte à vos projets

Chez ProteoGenix, notre IA (AI) exploite environ 10 milliards de séquences et s’améliore continuellement à chaque projet. Concrètement, cela permet :

• Accélérer les délais jusqu’à 80 % en priorisant les meilleurs candidats
• Réduire les coûts en concentrant les ressources sur les candidats les plus prometteurs dès le départ
• Explorer l’impossible : accéder à des espaces de séquences inaccessibles par les méthodes classiques
• Optimiser simultanément l’affinité, la stabilité, la fabricabilité (manufacturability) et l’immunogénicité

Notre approche : la boucle IA-Laboratoire

Notre méthodologie suit un cycle continu et itératif.

L’IA propose des variants optimisés, nous les produisons et les testons au laboratoire, et les résultats expérimentaux alimentent le modèle pour affiner les recommandations suivantes. Cette boucle garantit que chaque prédiction est validée par des données réelles, ce qui améliore continuellement nos modèles à chaque projet.

• Analyse – Nous définissons vos objectifs, contraintes et la stratégie d’optimisation en fonction des données disponibles.
• Design – L’IA explore l’espace des séquences et génère des variants optimisés pour vos critères spécifiques.
• Production – Les candidats sélectionnés sont exprimés et purifiés dans nos installations.
• Tests – Nous caractérisons chaque variant à l’aide des dosages pertinents pour mesurer les propriétés critiques.

Les résultats des tests alimentent le cycle IA suivant, créant une boucle de rétroaction qui accélère le développement tout en minimisant les risques.

Oui à l’IA… mais utilisée intelligemment

L’IA seule ne suffit pas. Pour garantir la fiabilité des résultats, elle doit être basée sur des données de qualité, validées expérimentalement, et interprétées par des experts maîtrisant à la fois l’IA (AI) et la biologie. Chez ProteoGenix, nous avons construit l’infrastructure pour rendre l’IA réellement efficace :

• Données entraînées sur ~10 milliards de séquences. Nos modèles apprennent uniquement à partir de résultats expérimentaux de haute qualité produits et vérifiés dans nos propres laboratoires.
• L’analyse structurale guide chaque design. Nous intégrons systématiquement la structure 3D et les interactions antigène, contrairement à la plupart des outils d’IA se basant uniquement sur les séquences.
• Analyse rigoureuse des séquences à chaque étape. Notre équipe de bioinformatique assure l’intégrité des séquences et détecte les problèmes potentiels avant la production.
• Chaque prédiction clé est testée. Nos laboratoires valident les recommandations et réintègrent les résultats pour améliorer les futures prédictions.
• Interprétation experte, pont entre IA et biologie. Notre équipe transforme les scores de l’IA en décisions concrètes : quels variants produire, quels tests réaliser, quels arbitrages accepter.

Nos services IA

ProteoGenix propose des outils avancés d’intelligence artificielle spécifiquement conçus pour optimiser chaque étape du développement d’anticorps :

• Optimisation : amélioration des propriétés biophysiques et de la stabilité de vos candidats
• Maturation d’affinité : augmentation de l’affinité en préservant les propriétés critiques
• Développabilité : réduction des risques d’agrégation, d’instabilité et de difficultés de production
• Humanisation : conversion des séquences en séquences humaines pour réduire l’immunogénicité
• Spéciation : conversion de séquences de l’espèce A vers l’espèce B tout en préservant leurs propriétés d’anticorps