Question 1

Qu’est-ce que le séquençage protéique d’anticorps de novo ?

Accepted Answer

Contrairement à un séquençage classique d’hybridome, le séquençage de novo détermine la séquence d’acides aminés d’un anticorps sans nécessiter d’ARNm, d’ADN ou de lignée cellulaire hybridome.
En analysant les différences de masse entre fragments ioniques, il devient possible de reconstruire les séquences peptidiques — la plupart des acides aminés ayant des masses uniques, le processus reste possible même sans information génétique.
L’interprétation MS/MS moderne repose sur l’expertise ou sur des algorithmes avancés (PEAKS, NOVOR). Malgré des défis (modifications post-traductionnelles, bruit, ions manquants), les technologies actuelles rendent le processus rapide, fiable et extrêmement précis.
Grâce aux dernières avancées en spectrométrie de masse, ProteoGenix garantit une précision de séquence proche de 100 %, y compris dans les régions CDR.

Question 2

Quels sont les avantages du séquençage protéique par rapport au séquençage d’ADN classique ?

Accepted Answer

Vous n’avez pas besoin d’une lignée cellulaire. En cas de perte d’hybridome, l’anticorps reste accessible.
Les modifications post-traductionnelles sont détectées (impossible en séquençage d’ADN).
Fonctionne pour tout isotype, toute espèce.
Adapté aux projets de séquençage à haut débit.

Cela en fait une solution de choix pour remplacer rapidement le séquençage hybride traditionnel.

Question 3

Combinez-vous plusieurs méthodes de fragmentation ?

Accepted Answer

Oui. Nous utilisons EThcD, qui allie la puissance d’ETD et de HCD.
Cette approche double permet :

Double confirmation des séquences
Meilleure préservation des modifications post-traductionnelles
Excellente précision dans les régions complexes comme la CDR-H3

Question 4

Quelle quantité d’anticorps faut-il fournir ?

Accepted Answer

Nous demandons en général 50–100 μg d’anticorps à une pureté >80 %.

Question 5

Une fois la séquence établie, pouvez-vous produire ou optimiser l’anticorps ?

Accepted Answer

Bien sûr. ProteoGenix est spécialiste de la production sur-mesure d’anticorps et de l’ingénierie en aval, de l’expression à l’optimisation fonctionnelle.
Toutes les séquences issues de notre service de séquençage peuvent être produites via notre plateforme de production d’anticorps recombinants, par expression transitoire ou via développement de lignée cellulaire.
Pour aller plus loin, nous proposons aussi :

Optimisation d’affinité
Humanisation d’anticorps
Analyse de développabilité

Besoin d’expression rapide, de production à grande échelle ou d’ingénierie avancée ? Notre plateforme accompagne chaque étape jusqu’aux anticorps optimisés.

Service de séquençage protéique d’anticorps de novo